前情提要：毛利小五郎，毛利兰，柯南以及苍天蓝羽受到一个名叫麻生圭二的人委托他们前往一个名叫月影岛的岛屿调查，可是就在他们抵达后从村公所主任口中得知委托人麻生圭二早就在十二年前就已经去世了，与此同时一桩连环杀人案也相继出现在四人面前，是谁委托四人来到月影岛的。另外，死去的几人跟十二年前死去麻生圭二又有什么联系，凶手又是谁，以及凶手的目的到底是什么？
书接上回，现任村长黑岩辰次死在广播室后众人开始调查现场，浅井成实医生对死去的黑岩辰次进行尸检后说道“我认为死者是在尸体被发现的前几分钟惨遭杀害的。”
目幕警官从播放器里拿出一张磁带“的确如此，这卷录音带的前面有五分三十秒左右的空白哦。”
“目幕警官，被害人的椅子
目幕警官和毛利小五郎走上去查看，与此同时柯南和苍天蓝羽走进现场，在现场里的人发现地上的痕迹是乐谱。
毛利小五郎说道“难不成这也是被害人留下来的遗言呐？”
柯南边做笔记边说道“不，不是的，如果还有时间跟体力用自己的血来写这些东西的话早就可以到外面去求救了啊。”
“所以，这应该是凶手故意留下来的……”话还没说完毛利小五郎给了柯南一拳，结果趴在了乐谱上面，连忙把人拎起来“笨蛋呐！不要碰重要的证据！可恶。”
几人看见证据没被破坏连忙松了口气，毛利小五郎把柯南放下“你这小鬼啊，老是捣蛋，给我到外面去，小羽毛你替我看着他。”
“切。”柯南离开，而苍天蓝羽笑了笑后跟在柯南后面。
解释现场勘探后，目幕警官说道“在受害人被杀害之后就会播出贝多芬的月光奏鸣曲，从其他的手法来看我认为杀害川岛先生和黑岩先生都是同一个人，而且从录音带的空白时间来看黑岩先生被杀害的时间应该是在被发现的数分钟之前，也就是六点三十分前后，也就是说那个时间在这个公民馆里的每一个人都有嫌疑，而这些人呢除了毛利先生四人之外。”
“有第一位发现尸体的西本健先生，刚才为我们验尸的浅井成实医生，被杀的黑岩村长的秘书平田和明先生，黑岩村长是女儿黑岩令子小姐和她的未婚夫村泽周一先生，还有村长选举人的候选人清水正人先生。”
黑岩令子站了出来“等一等啊，为什么我也变成嫌疑犯了呢？开玩笑，我从六点二十分左右开始就一直在接受你们的侦讯啊。”
毛利小五郎说道“的确，你是不可能会犯案的。”
毛利兰说道“那么成实医生也是一样的啊，因为从六点开始我们就一直在一起了，对不对啊柯南，还有小羽毛。”
“嗯。”柯南回答，站在旁边的苍天蓝羽也跟着点了点头。
目幕警官说道“这么说来的话那嫌疑犯就只剩下四个男人而已了。”
秘书平田和明走到目幕警官面前“这个目幕警官，我也是从六点多开始就一直待在这一层楼的啊。”
“那你有没有证人呢？”
秘书回头“你们应该都知道的吧，我那个时候是在这里的呀。”
清水正人说道“不好意思，我六点半左右去了一趟洗手间。”
“那么西本先生。”目幕警官走到西本健面前“你虽然是第一个发现黑岩先生尸体的人，不过呢你到那种地方去干什么呢？令人怀疑。”
“是黑岩叫我过去的。”
毛利小五郎把脸伸到西本健面前“哼，他叫你过去，你就把他杀了，是不是啊？”
“不是的。”
“是清水。”众人看向黑岩令子“村长选举的候选人，如果没有我爸爸跟川岛的话那么村长的位子就会变成这位清水先生的了。”
毛利兰回头看见苍天蓝羽蹲在地上和柯南在看笔记“柯南，你和小羽毛在看什么啊？”
“我和阿羽哥在看凶案现场当中凶手所留下的乐谱，我想那一定是凶手所留下的暗号。”
苍天蓝羽说“这个升记号跟降记号或许有什么样的关系。”
毛利兰说道“以钢琴来说的话是指黑色的键盘。”
“对吧？”
“键盘。”柯南和苍天蓝羽思考了起来。
黑岩令子朝着清水正人大喊“赶快把这个杀人魔王给我抓起来，如果不抓起来……”
“又有牺牲者了，明白吗？下一个就是你了。”众人看向苍天蓝羽。
“小羽毛？”
苍天蓝羽开始解释“这个暗号如果知道窍门的话就很简单了，从钢琴键盘的左边开始按照顺序将英文字母按照顺序放入，再把想传达的讯息以拼音方式用音符写在乐谱上面。”
“根据这个线索来念川岛先生被杀现场的那张乐谱就变成了‘明白了吗？下一个就是你’。”
“厉害啊小羽毛。”
“那么刚才用血所写出的乐谱呢？”
“罪孽的怨恨，在这里消除。”
秘书说道“罪孽的怨恨，该不会就是？”
苍天蓝羽说道“没错，那就是十二年前在火中弹奏钢琴的麻生圭二。”
西本健开始发疯“是那个家伙，麻生圭二他还活着呀！”
“他确实死了啊。”
老警察走了进来“当时在火灾现场中发现的骨头跟牙齿也经过比对，是他们一家人这是绝对没错的，当时所有东西都被烧毁了，只剩放在防火保险箱里面的乐谱。”
“乐谱！”所有人都大吃一惊。
毛利小五郎大喊“在哪里，那些乐谱现在在哪里啊！”
“在公民馆的仓库里头，可是仓库的钥匙在派出所里面呐。”
目幕警官大喊“那你还不快点去拿过来啊！快去！”
“是！”
“等一下警察先生，我跟你一起去。”柯南跟着跑了出去，苍天蓝羽看向毛利兰“我跟着他。”说完也跟着跑了出去。
三人走在前往派出所的路上，柯南问老警察“麻生先生真的是自己亲手放火烧死一家人吗？”
“因为有四位目击者看到的，前任村长龟山先生，还有黑岩村长，西本先生和川岛先生啊。”
苍天蓝羽问“那这四个人有什么关系啊？”
“包括麻生先生他们五个人从小就一块长大。”
“那个叫村泽周一的那个人呢？”
“那个家伙在三年前突然跑到这个岛上来，前些日子终于跟村长的千金小姐订了婚，不过村长是一直反对啊。”
柯南继续问“那村长的秘书那个叫平田的人呢？”
“那个男人呐，是个胆小懦弱的人，不太可能会干那种凶恶的行为的，不过我常在公民馆看到他跟川岛先生鬼鬼祟祟。”
“清水先生人怎么样啊？”
“他正义感很强啊，很受渔民的爱戴的。”
没有什么问题后柯南和苍天蓝羽继续跟着老警察走，老警察看向二人“你们还有话要问吗？两位侦探？”
“没了，一时半会也想不到什么问题了。”
三人抵达了派出所，老警察在里面四处翻找“奇怪了，应该是放在这附近才对的啊！”
柯南坐在椅子上，苍天蓝羽背靠在墙上，二人吐槽，这都已经找了一个多小时了。
终于老警察找到了钥匙“找到了找到了，就是这把钥匙，就是它。”
三人正准备走的时候毛利兰跑到派出所门口“警察先生。”
“小兰姐？”
“太，太慢了啦，大家等得不耐烦都已经回去了。”
柯南大喊“什，什么！嫌犯全部都回去了？”
“是啊，犯人最后留下的讯息是罪孽的怨恨在这里消除表示已经完结了。”
兄弟二人心想：怎么可能，到目前为止杀人现场播放的是月光的第一跟第二乐章，而且月光这首曲子其实还有第三乐章啊。
柯南说道“阿羽哥，我们去公民馆那里看一看。”
“嗯。”说完兄弟二人跑向公民馆，毛利兰和老警察紧随其后。
抵达公民馆后老警察拿出钥匙打开仓库，同时二人听见了钢琴房里传来声音 柯南指向钢琴房“刚才有没有听到钢琴房里传出奇怪的声音啊？”
毛利兰回答没有，柯南和苍天蓝羽看着对方点了点头后跑向钢琴房，推开房门后二人看见一个黑影跳窗跑了出去。
“你给我站住！”苍天蓝羽跟着跳出窗户去追黑影，柯南原本也要跟上去结果被绊倒“起身后看见村泽周一趴在地上呻吟，同时听见了毛利兰的惨叫。
“小兰！”
跑到仓库门口后看见西本健被吊死在仓库里面“警察先生，快点通知目幕警官呐。”
“我知道了。”连忙跑出公民馆去叫人。
“柯南，小羽毛呢？”
“阿羽哥跳出窗户去追人去了。”
柯南走进仓库发现了摆在一旁的播放器“这里有第三章的乐谱吗？单面三十分钟的录音带这么说来西本先生死亡是距离现在三十分钟以内。”
毛利兰指向死去的西本健“柯南你看，西本先生的脚下又有乐谱了。”
柯南走过去查看地上的乐谱，毛利兰问柯南“这次到底是为什么呢？”
“遗书。”
“遗书？那，那么……”
目幕警官带队来到现场勘察，毛利小五郎问目幕警官“这上面写的什么？”
“根据遗书所写的，他因为杀了川岛氏和黑岩氏心中后悔。”
“西本杀了那两个人？”
“动机好像是因为他们五个人以前曾经犯过错，为了不想被揭穿而杀人灭口，这五人指的是两年前死亡的龟山，还有这些被杀的川岛和黑岩，上吊自杀而死的西本，以及十二年前燃火自焚的麻生圭二。”
“那，那位钢琴家的……”
“他们利用这些暗号到底是在做些什么事情呢？”
“原本西本是因为害怕过去的秘密被发现，所以潜进这间仓库想要把乐谱给销毁，可是却找不到乐谱，由于已经走投无路了才选择自杀的。”
柯南说道“我倒不认为是自杀哦。”两人看向柯南。
“因为没有垫脚的东西就没有办法上吊自杀呀。”
毛利小五郎走上去“那会不会是你收起来了呢？”
“这怎么可能嘛，而且啊，我也认为没有人会特地用这些暗号来写自己的遗书。”
目幕警官说道“那你的意思是说凶手另有他人吗？”
“当时我和阿羽哥有看到一个可疑的人哦。”
“什么！”
“在钢琴的房间里面有两个人，一个人破窗逃跑了，不过阿羽哥也跟着跳窗出去追去了。另一个人就是村泽先生了，当时啊，他不知道被谁打晕了现在在就在钢琴房里面接受成实医生的治疗呢。”
毛利小五郎给了柯南一拳“你怎么不早说，我是说怎么没看见小羽毛。”
“爸爸！”
目幕警官走到仓库门口“怎么样啊，麻生所留下的乐谱到现在还没发现吗？”
“再怎么说都是十二年前的事情了呀，放哪去了。”
此时所有人听见大门传来动静，走过去后看见苍天蓝羽捂住腹部的伤口扶着墙一步步走上前，毛利兰看见后连忙冲上去扶着受伤的苍天蓝羽“小羽毛你受伤了。”
“我原本以为我快要追上黑影了，可是没想到这家伙故意把我引到了附近的树林里，趁我不备给了我一刀，不过好在不是很严重。”
毛利小五郎转头大喊“快去叫成实医生！”
把苍天蓝羽扶到钢琴房后浅井成实开始给他处理伤口，处理好伤口后柯南走了过来把之前发现都事情和线索告诉了他，然后跟着其他人围在昏迷不醒的村泽周一身边。
目幕警官说道“还没有恢复意识是吗？”
浅井成实回答“是的，我想大概是脑震荡吧。”
目幕警官看向黑岩令子“不过黑岩小姐，我想问你已经这么晚了村里先生到底是在这里做什么呢？”
“这我怎么会知道呢？”
这时兄弟二人发现村泽周一手边有东西，于是柯南就拿了起来，黑岩令子看见后直接夺了过来“你不要乱碰周一的东西好不好。”
目幕警官看向黑岩令子手上拿的东西“那个是什么东西啊？”